使命召唤12：黑色行动3的故事背景将发生在未来世界，社会所担心的诸多问题已成为了现实：环境的变化和能源短缺导致各国战乱频繁等等。

同时，在未来战场上随着自动机械化的发展，无人机和机械化士兵占据了主导地位，而超级士兵们虽然战斗力极强，但人性也随之逐渐泯灭。

本作的故事情节是一部反乌托邦性质的科幻故事，可能我们已经司空见惯了，不过有些新内容玩家可能会觉得有些陌生，比如一名类似“斯诺登”的人物将在游戏的争端中扮演很重要的角色。

游戏的故事发生在未来世界，社会所担心的诸多问题已成为现实：环境的变化和能源短缺导致各国战乱频繁等等。

同时，在未来战场上随着自动机械化的发展，无人机和机械化士兵占据了主导地位，而超级士兵们虽然战斗力极强，但人性也随之逐渐泯灭。

背景故事设定为，玩家作为一支数字改造黑色行动部队的一员，在新加坡的一次调查行动中与半数队友突然失去了联系。

这是因为一次大型的军事资料泄露事件引起的，而这起事件也导致全球范围内的各类秘密活动失败。

玩家的任务就是找到自己的团队，并揭露事情的真相。