《午夜之谜：密西西比河之恶魔》中，马克吐温的鬼魂来寻求帮助。他对文学史的热情追求引起了一场关于莎士比亚真实身份的争议，唤醒了黑暗中另一个相关的因素——恶灵，并且一系列阴谋也在逐渐升级。玩家的任务就是和马克吐温一起消灭恶灵，你要在马克吐温灵魂的帮助下，解开这个历史之谜。

《午夜之谜：密西西比河之恶魔》有八个冒险任务，因为是收藏版游戏，所以里面会有类似策略指导的额外部分。开发人员称他们对这一部感到非常满意，这是《午夜之谜》最好的一部。

前两作分别为午夜迷踪之爱伦坡谋杀案和午夜迷踪2：塞勒姆女巫的审判。在每一部中都是有个鬼魂来找到主角请求帮助，然后主角展开一系列的旅程，本作中，前来找主角寻求帮助的是大名鼎鼎的马克吐温的鬼魂，帮助他还原记忆，收集线索，直至一步步解开隐藏的恶魔之谜！