命令与征服红色警戒3是一款即时战略游戏，该游戏是《命令与征服：红色警戒》系列的第三部。故事围绕虚构的“第三次世界大战”，苏联库可夫将军以及前任苏军上校阿纳托利·查丹科改写了历史，该行动造成了一个新的国家崛起：旭日帝国。最终苏联、盟军与旭日帝国形成了三足鼎立的局面。

故事描述强大的苏俄军队节节败退，盟军准备一举攻入克里姆林宫，库可夫将军以及查丹科上校决心孤注一掷，使用了未经测试的秘密武器：俄军时空机器；结果，他们改写了历史，在总理查丹科的领导下，让盟军濒临战败边缘，但他们却意外发现，昇阳帝国悄悄地坐大，神圣的天皇芳朗选择在此时刻发动攻击。当天皇的帝国军队带来了巨大威胁，准备将俄军和盟军从地球上消灭殆尽。从这一刻起，世界的发展全然掌握在玩家的手里，当盟军、俄军与昇阳帝国三大阵营在玩家眼前，玩家该如何抉择？无论选择投身任一阵营，都将写下历史新页。

由于盟军拥有爱因斯坦实验室与高强的科技，苏联被打到了国境附近，只要再次失败，就会使国家沦陷。就在危急时刻，苏联领导人决定使用没有实验过的苏联版时间机器，回到过去并抹杀了爱因斯坦。回到了现代后，果然，盟军的威胁减少了很多。但是，苏盟大战的胜利使苏军忘记顾及太平洋地区的军事，使得升阳帝国崛起，并派出舰队准备袭击苏俄。苏联领导人发现后，马上下令用核弹反击，可是他们忘记了，爱因斯坦被抹杀后，核弹也不曾存在过了。

苏联

苏联任务从抵御帝国入侵，到进攻欧洲，反击帝国，最终战胜帝国和美国为止。其中包括除掉（被诬陷）背叛的库可夫将军以及与总理反目的剧情，还曾击败升阳帝国的三名指挥官，杀死芳郎天皇，最终玩家扮演的将军成为万人景仰的新总理。

盟军

盟军起初拼死抵抗进攻的苏军，然后联合苏联对付帝国。其间杀死反共的总统阿克曼，又与苏联重新对立，终于打败另外两方。最后原副总统担任新总统，规划了建立自由平等的新世界的宏伟蓝图。

升阳帝国

帝国起初突袭苏联，再到抵御盟军（后来对抗苏盟联军），最后反击苏联和欧洲获取胜利。（对苏战争结果：摧毁克里姆林宫和时间机器，击败塞林斯基博士）其中天皇之子达朗的超级机器人“将军刽子手” 科幻色彩十足，威力非常强大。