东方深秘录是一款动作格斗类游戏，本作的主题是“都市传说”，也就是故事背景民间流传的故事。东方PROJECT的主要角色都会有全新的灵异名和必杀技，比如博丽灵梦的灵异名是“隙间女”。

人类村落里出现了奇妙的流言。

「长着人脸的狗在翻肥料堆」

「有人看到老婆婆在卖人脚」

这种无聊的流言爆炸式地传开，让孩子们陷入了恐慌。

这些流言既真相难解又阴森恐怖，和以袭击人类为本分的妖怪完全不同。

因为没有出现实际受害者，渐渐地大人们只把它们看作是孩子们的玩笑话。

当然，她们也是不会害怕的。

因为她们知道这就是外面世界的“都市传说(编出来的故事)”。

都市传说有个很奇妙的特征。

就是随着口头流传的流言发生变化，怪异现象也会相应地变化。

灵梦她们披上和自身相符的流言，像玩具一样玩弄着这些怪异。

只要胆子大，敢于主动去操控流言，就能让显现出的怪异变得无害。不仅如此，甚至可以将其化为自己的力量。

她们认为，由自己来操纵都市传说，是防止其他人受害必要的手段。

事实也的确如此，直到某一天的夜里。

神秘地点与灵异珠：战斗中，时而灵异珠会出现在画面之中，令战场化为神秘地点。在神秘地点之中双方会在施以特殊规则的情况下进行游戏。