东方星莲船是一款弹幕射击类游戏，幻想乡的上空出现了不明飞行物，但是灵梦与魔理沙却只顾着唠嗑完全没有注意到，直到新来的巫女东风谷早苗的提醒，三人才开始了这次冒险之旅。

有一只手柄，对某程度的弹幕免疫，觉得有在天上飞的信心，然而有个不可思议的传闻，在云的断层间有许多UFO在飘荡，而那些UFO反复是在寻找着什么...丽灵梦于是和自己的朋友，决定追击那些UFO，一探究竟。

游戏拥3个角色可以进行操作，分别是博丽灵梦、雾雨魔理沙以及东风谷早苗。

本作特有的UFO系统，不同的UFO会有不同效果，合理运用是通关游戏的关键。

游戏分为4个难度，可以让所有玩家依据自己水平找到合适的难度进行游戏。

游戏共有6个关卡，每个关卡都有自己的特色，达成一定条件后可以开启Extra模式挑战。