口袋妖怪水晶日版是神奇宝贝系列游戏的第七个作品（美版为第六个，因为美版没有推出蓝版）它是一年前金银的重制版。它的冒险地区与前作的金银版相同，是城都地方，并且在通关后可以前往关都地方冒险。感兴趣的玩家朋友快来52z飞翔下载体验吧！

由于移动适配器GB的存在，日文水晶版的很多设定与海外版完全不同，并且随着移动系统GB的关闭，很多内容在之后的重制版心金魂银版中也没有出现：

在日文版中，时拉比可以通过移动适配器GB获得的GS球事件来捕捉，而在海外版中，这些数据仍然在游戏中且已经翻译为了对应语言，但是事件却被取消了。

在日文版中，满金市的宝可梦中心被替换成宝可梦交流中心，而海外版中这里依然是宝可梦中心，

在日文版中，可以宝可梦交流中心的交易柜台使用移动适配器GB与其他玩家交换宝可梦，如同之后的GTS，同时可以在这里交换宝可梦的蛋兑换券。在新闻机器可以看到全日本上传存档数据的玩家的冒险进度，但海外版无法使用此服务。

在日文版中奇怪的蛋由于需要宝可梦的蛋兑换券兑换才能获得，因此有50%的几率是异色的，而在海外版中可以直接获得奇怪的蛋，因此只有14%的几率是异色。

对战塔在日文版中需要连接移动适配器GB才可进入，而在海外版则可以直接进入